Filtreringssystemet af Gulvstøvsuger spiller en afgørende rolle i forebyggelsen af sekundær forurening.
Gulvstøvsugerfiltreringssystemet af høj kvalitet anvender flere filtreringsteknologier. Almindelige er primær filtrering, som generelt er et filter eller filterbomuld, som kan bortfiltrere store partikler af støv og snavs, såsom hår, snavs osv. Dette er den første forsvarslinje mod sekundær forurening. For eksempel kan det primære filter i nogle støvsugere effektivt opfange større partikler, der er synlige for det blotte øje, hvilket reducerer byrden af efterfølgende filtreringsforbindelser.
Dernæst er det højeffektive filterlag, såsom HEPA. Den kan nøjagtigt filtrere små støvpartikler, og filtreringseffektiviteten for partikler på 0,3 mikron og derover kan være så høj som 99,97 % eller endnu højere. Det betyder, at næsten alt skadeligt støv, der suges ind i støvsugeren, kan opsnappes og ikke vil blive udledt i luften igen, hvorved man undgår forurening af indeluften og skader på de menneskelige luftveje.
Nogle støvsugere bruger også filterlag med aktivt kul, som kan absorbere lugte og skadelige gasmolekyler, såsom formaldehyd og benzen. Især ved rengøring af kæledyrshår, fugtige miljøer eller områder med lugt, kan det aktive kulfilterlag effektivt fjerne lugte, gøre den udsugede luft friskere, forbedre renseeffekten yderligere og forhindre sekundær forurening forårsaget af lugte og skadelige gasser.
Derudover har filtreringssystemet i nogle avancerede gulvstøvsugere også en selvrensende funktion. Under driften af støvsugeren renses støvet på filternettet i tide gennem omvendt luftstrøm eller vibration, hvilket bibeholder filternettets permeabilitet og filtreringseffektivitet og undgår faldet i sugning og sekundær forurening forårsaget af filterblokering. For eksempel kan nogle støvsugere med cyklonseparationsteknologi adskille støv fra filternettet gennem stærk centrifugalkraft under filtreringsprocessen og slippe det ned i støvopsamlingsspanden, hvilket sikrer, at filtreringssystemet altid holder en god arbejdstilstand.